Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD10P28358 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms