Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEFLP07196 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEFLP07196 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEFLP07196 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEFLP07196 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEFLP07196 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEFLP07196 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEFLP07196 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NEFLP07196 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEFLP07196 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEFLP07196 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEFLP07196 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEFLP07196 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEFLP07196 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEFLP07196 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEFLP07196 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEFLP07196 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEFLP07196 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEFLP07196 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEFLP07196 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEFLP07196 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEFLP07196 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEFLP07196 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEFLP07196 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEFLP07196 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEFLP07196 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEFLP07196 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEFLP07196 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEFLP07196 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEFLP07196 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEFLP07196 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEFLP07196 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEFLP07196 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEFLP07196 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEFLP07196 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEFLP07196 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEFLP07196 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEFLP07196 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEFLP07196 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEFLP07196 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEFLP07196 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEFLP07196 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEFLP07196 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEFLP07196 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEFLP07196 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEFLP07196 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEFLP07196 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEFLP07196 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEFLP07196 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEFLP07196 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEFLP07196 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEFLP07196 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEFLP07196 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEFLP07196 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEFLP07196 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEFLP07196 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEFLP07196 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEFLP07196 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEFLP07196 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEFLP07196 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEFLP07196 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEFLP07196 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NEFLP07196 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEFLP07196 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEFLP07196 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEFLP07196 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEFLP07196 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEFLP07196 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEFLP07196 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEFLP07196 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEFLP07196 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEFLP07196 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEFLP07196 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NEFLP07196 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEFLP07196 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEFLP07196 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEFLP07196 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEFLP07196 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEFLP07196 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEFLP07196 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEFLP07196 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEFLP07196 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEFLP07196 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEFLP07196 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEFLP07196 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEFLP07196 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEFLP07196 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEFLP07196 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEFLP07196 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEFLP07196 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEFLP07196 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEFLP07196 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEFLP07196 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEFLP07196 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEFLP07196 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NEFLP07196 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEFLP07196 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEFLP07196 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEFLP07196 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEFLP07196 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms