Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
J3KRW8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3KRW8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3KRW8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3KRW8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3KRW8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3KRW8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
J3KRW8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3KRW8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3KRW8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3KRW8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3KRW8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3KRW8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3KRW8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3KRW8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3KRW8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3KRW8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3KRW8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3KRW8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3KRW8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3KRW8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3KRW8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3KRW8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3KRW8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3KRW8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3KRW8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3KRW8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3KRW8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3KRW8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3KRW8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3KRW8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3KRW8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3KRW8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
J3KRW8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
J3KRW8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
J3KRW8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
J3KRW8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
J3KRW8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3KRW8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3KRW8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3KRW8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
J3KRW8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3KRW8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3KRW8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3KRW8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3KRW8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3KRW8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3KRW8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3KRW8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3KRW8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3KRW8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3KRW8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3KRW8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3KRW8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3KRW8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3KRW8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3KRW8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3KRW8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3KRW8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3KRW8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3KRW8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3KRW8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3KRW8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3KRW8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3KRW8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3KRW8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3KRW8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3KRW8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3KRW8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3KRW8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3KRW8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3KRW8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
J3KRW8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3KRW8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3KRW8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3KRW8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3KRW8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3KRW8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3KRW8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3KRW8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3KRW8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3KRW8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3KRW8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
J3KRW8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3KRW8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3KRW8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3KRW8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3KRW8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3KRW8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3KRW8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3KRW8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
J3KRW8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3KRW8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3KRW8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3KRW8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3KRW8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3KRW8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3KRW8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3KRW8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3KRW8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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