Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BHMG1C9JSJ3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHMG1C9JSJ3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms