Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARFGEF2Q9Y6D5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARFGEF2Q9Y6D5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms