Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF12Q9Y4X4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms