Protein–RNA interactions for Protein: Q99797

MIPEP, Mitochondrial intermediate peptidase, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPEPQ99797 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MIPEPQ99797 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIPEPQ99797 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms