Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY52

ZIK1, Zinc finger protein interacting with ribonucleoprotein K, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIK1Q3SY52 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIK1Q3SY52 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIK1Q3SY52 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIK1Q3SY52 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIK1Q3SY52 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIK1Q3SY52 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIK1Q3SY52 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIK1Q3SY52 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIK1Q3SY52 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIK1Q3SY52 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIK1Q3SY52 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIK1Q3SY52 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIK1Q3SY52 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIK1Q3SY52 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIK1Q3SY52 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIK1Q3SY52 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIK1Q3SY52 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIK1Q3SY52 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZIK1Q3SY52 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZIK1Q3SY52 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZIK1Q3SY52 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZIK1Q3SY52 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZIK1Q3SY52 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms