Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.57■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.57■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.56■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.55■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.54■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.53■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
COL24A1Q17RW2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms