Protein–RNA interactions for Protein: Q13068

GAGE4, G antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAGE4Q13068 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GAGE4Q13068 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAGE4Q13068 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAGE4Q13068 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAGE4Q13068 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAGE4Q13068 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAGE4Q13068 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAGE4Q13068 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GAGE4Q13068 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAGE4Q13068 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAGE4Q13068 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAGE4Q13068 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAGE4Q13068 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAGE4Q13068 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAGE4Q13068 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAGE4Q13068 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAGE4Q13068 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAGE4Q13068 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GAGE4Q13068 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GAGE4Q13068 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GAGE4Q13068 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GAGE4Q13068 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GAGE4Q13068 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GAGE4Q13068 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GAGE4Q13068 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GAGE4Q13068 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GAGE4Q13068 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GAGE4Q13068 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms