Protein–RNA interactions for Protein: Q00005

PPP2R2B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2BQ00005 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP2R2BQ00005 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP2R2BQ00005 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP2R2BQ00005 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP2R2BQ00005 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP2R2BQ00005 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP2R2BQ00005 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP2R2BQ00005 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP2R2BQ00005 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP2R2BQ00005 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP2R2BQ00005 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP2R2BQ00005 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP2R2BQ00005 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP2R2BQ00005 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP2R2BQ00005 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP2R2BQ00005 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP2R2BQ00005 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP2R2BQ00005 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP2R2BQ00005 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP2R2BQ00005 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP2R2BQ00005 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPP2R2BQ00005 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPP2R2BQ00005 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP2R2BQ00005 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms