Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH5P33151 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH5P33151 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH5P33151 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH5P33151 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH5P33151 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH5P33151 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH5P33151 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH5P33151 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH5P33151 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH5P33151 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH5P33151 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH5P33151 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH5P33151 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH5P33151 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH5P33151 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH5P33151 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH5P33151 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH5P33151 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH5P33151 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH5P33151 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH5P33151 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH5P33151 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH5P33151 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH5P33151 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH5P33151 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH5P33151 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH5P33151 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDH5P33151 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDH5P33151 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDH5P33151 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH5P33151 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH5P33151 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH5P33151 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH5P33151 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH5P33151 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH5P33151 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH5P33151 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH5P33151 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH5P33151 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH5P33151 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH5P33151 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH5P33151 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH5P33151 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH5P33151 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH5P33151 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH5P33151 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH5P33151 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH5P33151 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH5P33151 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH5P33151 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH5P33151 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH5P33151 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH5P33151 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH5P33151 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH5P33151 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH5P33151 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH5P33151 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH5P33151 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH5P33151 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH5P33151 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH5P33151 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH5P33151 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH5P33151 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH5P33151 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH5P33151 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH5P33151 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH5P33151 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH5P33151 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH5P33151 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH5P33151 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH5P33151 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH5P33151 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH5P33151 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH5P33151 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH5P33151 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH5P33151 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH5P33151 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH5P33151 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH5P33151 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH5P33151 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH5P33151 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH5P33151 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH5P33151 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH5P33151 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH5P33151 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH5P33151 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH5P33151 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH5P33151 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH5P33151 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH5P33151 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH5P33151 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH5P33151 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH5P33151 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH5P33151 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH5P33151 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDH5P33151 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH5P33151 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH5P33151 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH5P33151 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms