Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIAA1549Q9HCM3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIAA1549Q9HCM3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIAA1549Q9HCM3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIAA1549Q9HCM3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIAA1549Q9HCM3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIAA1549Q9HCM3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIAA1549Q9HCM3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIAA1549Q9HCM3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIAA1549Q9HCM3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIAA1549Q9HCM3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIAA1549Q9HCM3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIAA1549Q9HCM3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIAA1549Q9HCM3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIAA1549Q9HCM3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIAA1549Q9HCM3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIAA1549Q9HCM3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIAA1549Q9HCM3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIAA1549Q9HCM3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIAA1549Q9HCM3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIAA1549Q9HCM3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIAA1549Q9HCM3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIAA1549Q9HCM3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1549Q9HCM3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1549Q9HCM3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA1549Q9HCM3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIAA1549Q9HCM3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIAA1549Q9HCM3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIAA1549Q9HCM3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIAA1549Q9HCM3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIAA1549Q9HCM3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIAA1549Q9HCM3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KIAA1549Q9HCM3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIAA1549Q9HCM3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIAA1549Q9HCM3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIAA1549Q9HCM3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIAA1549Q9HCM3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIAA1549Q9HCM3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIAA1549Q9HCM3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIAA1549Q9HCM3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIAA1549Q9HCM3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIAA1549Q9HCM3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIAA1549Q9HCM3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIAA1549Q9HCM3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KIAA1549Q9HCM3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIAA1549Q9HCM3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIAA1549Q9HCM3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIAA1549Q9HCM3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIAA1549Q9HCM3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KIAA1549Q9HCM3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIAA1549Q9HCM3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIAA1549Q9HCM3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIAA1549Q9HCM3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIAA1549Q9HCM3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KIAA1549Q9HCM3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIAA1549Q9HCM3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIAA1549Q9HCM3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIAA1549Q9HCM3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIAA1549Q9HCM3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIAA1549Q9HCM3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIAA1549Q9HCM3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIAA1549Q9HCM3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIAA1549Q9HCM3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIAA1549Q9HCM3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIAA1549Q9HCM3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIAA1549Q9HCM3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KIAA1549Q9HCM3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KIAA1549Q9HCM3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIAA1549Q9HCM3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIAA1549Q9HCM3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA1549Q9HCM3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA1549Q9HCM3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA1549Q9HCM3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA1549Q9HCM3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA1549Q9HCM3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA1549Q9HCM3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA1549Q9HCM3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIAA1549Q9HCM3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIAA1549Q9HCM3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA1549Q9HCM3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KIAA1549Q9HCM3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIAA1549Q9HCM3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIAA1549Q9HCM3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIAA1549Q9HCM3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIAA1549Q9HCM3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIAA1549Q9HCM3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIAA1549Q9HCM3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIAA1549Q9HCM3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIAA1549Q9HCM3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA1549Q9HCM3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIAA1549Q9HCM3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIAA1549Q9HCM3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIAA1549Q9HCM3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIAA1549Q9HCM3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIAA1549Q9HCM3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIAA1549Q9HCM3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIAA1549Q9HCM3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIAA1549Q9HCM3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIAA1549Q9HCM3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIAA1549Q9HCM3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms