Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRFN3Q9BTN0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRFN3Q9BTN0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRFN3Q9BTN0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRFN3Q9BTN0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRFN3Q9BTN0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRFN3Q9BTN0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRFN3Q9BTN0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRFN3Q9BTN0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRFN3Q9BTN0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRFN3Q9BTN0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRFN3Q9BTN0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRFN3Q9BTN0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRFN3Q9BTN0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
LRFN3Q9BTN0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRFN3Q9BTN0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRFN3Q9BTN0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRFN3Q9BTN0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRFN3Q9BTN0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRFN3Q9BTN0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRFN3Q9BTN0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRFN3Q9BTN0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRFN3Q9BTN0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRFN3Q9BTN0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRFN3Q9BTN0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRFN3Q9BTN0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRFN3Q9BTN0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRFN3Q9BTN0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRFN3Q9BTN0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRFN3Q9BTN0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRFN3Q9BTN0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRFN3Q9BTN0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRFN3Q9BTN0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRFN3Q9BTN0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRFN3Q9BTN0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRFN3Q9BTN0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LRFN3Q9BTN0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRFN3Q9BTN0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRFN3Q9BTN0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRFN3Q9BTN0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRFN3Q9BTN0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRFN3Q9BTN0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRFN3Q9BTN0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRFN3Q9BTN0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRFN3Q9BTN0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRFN3Q9BTN0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRFN3Q9BTN0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRFN3Q9BTN0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRFN3Q9BTN0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRFN3Q9BTN0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRFN3Q9BTN0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LRFN3Q9BTN0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRFN3Q9BTN0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRFN3Q9BTN0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LRFN3Q9BTN0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LRFN3Q9BTN0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LRFN3Q9BTN0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRFN3Q9BTN0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRFN3Q9BTN0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRFN3Q9BTN0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LRFN3Q9BTN0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRFN3Q9BTN0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRFN3Q9BTN0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRFN3Q9BTN0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRFN3Q9BTN0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LRFN3Q9BTN0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRFN3Q9BTN0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRFN3Q9BTN0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRFN3Q9BTN0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRFN3Q9BTN0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRFN3Q9BTN0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRFN3Q9BTN0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRFN3Q9BTN0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRFN3Q9BTN0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRFN3Q9BTN0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRFN3Q9BTN0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRFN3Q9BTN0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRFN3Q9BTN0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRFN3Q9BTN0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRFN3Q9BTN0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRFN3Q9BTN0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRFN3Q9BTN0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRFN3Q9BTN0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRFN3Q9BTN0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRFN3Q9BTN0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRFN3Q9BTN0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRFN3Q9BTN0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRFN3Q9BTN0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRFN3Q9BTN0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRFN3Q9BTN0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRFN3Q9BTN0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRFN3Q9BTN0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRFN3Q9BTN0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRFN3Q9BTN0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LRFN3Q9BTN0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRFN3Q9BTN0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRFN3Q9BTN0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRFN3Q9BTN0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRFN3Q9BTN0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRFN3Q9BTN0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms