Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TSC1Q92574 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TSC1Q92574 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TSC1Q92574 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TSC1Q92574 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TSC1Q92574 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TSC1Q92574 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TSC1Q92574 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TSC1Q92574 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TSC1Q92574 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TSC1Q92574 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TSC1Q92574 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TSC1Q92574 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TSC1Q92574 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TSC1Q92574 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TSC1Q92574 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TSC1Q92574 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TSC1Q92574 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TSC1Q92574 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TSC1Q92574 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TSC1Q92574 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TSC1Q92574 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TSC1Q92574 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TSC1Q92574 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TSC1Q92574 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TSC1Q92574 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TSC1Q92574 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TSC1Q92574 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TSC1Q92574 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TSC1Q92574 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TSC1Q92574 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TSC1Q92574 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TSC1Q92574 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TSC1Q92574 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TSC1Q92574 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TSC1Q92574 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TSC1Q92574 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TSC1Q92574 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TSC1Q92574 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TSC1Q92574 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TSC1Q92574 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TSC1Q92574 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TSC1Q92574 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TSC1Q92574 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TSC1Q92574 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TSC1Q92574 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TSC1Q92574 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TSC1Q92574 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TSC1Q92574 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TSC1Q92574 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TSC1Q92574 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TSC1Q92574 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TSC1Q92574 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TSC1Q92574 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TSC1Q92574 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TSC1Q92574 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TSC1Q92574 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TSC1Q92574 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TSC1Q92574 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TSC1Q92574 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TSC1Q92574 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TSC1Q92574 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TSC1Q92574 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TSC1Q92574 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TSC1Q92574 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TSC1Q92574 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TSC1Q92574 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TSC1Q92574 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TSC1Q92574 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TSC1Q92574 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TSC1Q92574 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TSC1Q92574 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TSC1Q92574 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TSC1Q92574 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TSC1Q92574 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TSC1Q92574 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TSC1Q92574 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TSC1Q92574 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TSC1Q92574 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TSC1Q92574 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TSC1Q92574 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TSC1Q92574 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TSC1Q92574 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TSC1Q92574 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TSC1Q92574 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TSC1Q92574 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TSC1Q92574 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TSC1Q92574 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TSC1Q92574 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TSC1Q92574 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TSC1Q92574 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TSC1Q92574 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TSC1Q92574 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TSC1Q92574 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TSC1Q92574 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TSC1Q92574 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TSC1Q92574 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TSC1Q92574 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TSC1Q92574 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TSC1Q92574 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms