Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC12Q8WUD4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC12Q8WUD4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC12Q8WUD4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC12Q8WUD4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC12Q8WUD4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC12Q8WUD4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC12Q8WUD4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC12Q8WUD4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC12Q8WUD4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC12Q8WUD4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC12Q8WUD4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC12Q8WUD4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC12Q8WUD4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC12Q8WUD4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC12Q8WUD4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC12Q8WUD4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC12Q8WUD4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC12Q8WUD4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC12Q8WUD4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC12Q8WUD4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC12Q8WUD4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC12Q8WUD4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC12Q8WUD4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC12Q8WUD4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC12Q8WUD4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC12Q8WUD4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC12Q8WUD4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC12Q8WUD4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC12Q8WUD4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC12Q8WUD4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC12Q8WUD4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC12Q8WUD4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC12Q8WUD4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC12Q8WUD4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC12Q8WUD4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC12Q8WUD4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC12Q8WUD4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC12Q8WUD4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC12Q8WUD4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC12Q8WUD4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC12Q8WUD4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC12Q8WUD4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC12Q8WUD4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC12Q8WUD4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC12Q8WUD4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC12Q8WUD4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC12Q8WUD4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC12Q8WUD4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC12Q8WUD4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC12Q8WUD4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC12Q8WUD4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC12Q8WUD4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CCDC12Q8WUD4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC12Q8WUD4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC12Q8WUD4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC12Q8WUD4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC12Q8WUD4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC12Q8WUD4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC12Q8WUD4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC12Q8WUD4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC12Q8WUD4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC12Q8WUD4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC12Q8WUD4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC12Q8WUD4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC12Q8WUD4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC12Q8WUD4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC12Q8WUD4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC12Q8WUD4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC12Q8WUD4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC12Q8WUD4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC12Q8WUD4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC12Q8WUD4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
CCDC12Q8WUD4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CCDC12Q8WUD4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC12Q8WUD4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC12Q8WUD4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC12Q8WUD4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC12Q8WUD4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC12Q8WUD4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC12Q8WUD4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC12Q8WUD4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC12Q8WUD4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC12Q8WUD4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC12Q8WUD4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC12Q8WUD4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC12Q8WUD4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC12Q8WUD4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC12Q8WUD4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC12Q8WUD4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC12Q8WUD4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC12Q8WUD4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC12Q8WUD4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC12Q8WUD4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC12Q8WUD4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC12Q8WUD4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC12Q8WUD4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC12Q8WUD4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC12Q8WUD4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC12Q8WUD4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms