Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGU0

TSPO2, Translocator protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPO2Q5TGU0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPO2Q5TGU0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPO2Q5TGU0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPO2Q5TGU0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPO2Q5TGU0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPO2Q5TGU0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPO2Q5TGU0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPO2Q5TGU0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPO2Q5TGU0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPO2Q5TGU0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPO2Q5TGU0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPO2Q5TGU0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPO2Q5TGU0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPO2Q5TGU0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPO2Q5TGU0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPO2Q5TGU0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPO2Q5TGU0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPO2Q5TGU0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPO2Q5TGU0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPO2Q5TGU0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPO2Q5TGU0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPO2Q5TGU0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPO2Q5TGU0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPO2Q5TGU0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPO2Q5TGU0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPO2Q5TGU0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPO2Q5TGU0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TSPO2Q5TGU0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPO2Q5TGU0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPO2Q5TGU0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPO2Q5TGU0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPO2Q5TGU0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPO2Q5TGU0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPO2Q5TGU0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPO2Q5TGU0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPO2Q5TGU0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPO2Q5TGU0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPO2Q5TGU0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPO2Q5TGU0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSPO2Q5TGU0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSPO2Q5TGU0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSPO2Q5TGU0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSPO2Q5TGU0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPO2Q5TGU0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPO2Q5TGU0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPO2Q5TGU0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPO2Q5TGU0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPO2Q5TGU0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPO2Q5TGU0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPO2Q5TGU0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPO2Q5TGU0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPO2Q5TGU0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSPO2Q5TGU0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPO2Q5TGU0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPO2Q5TGU0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPO2Q5TGU0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPO2Q5TGU0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSPO2Q5TGU0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPO2Q5TGU0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPO2Q5TGU0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPO2Q5TGU0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPO2Q5TGU0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPO2Q5TGU0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPO2Q5TGU0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPO2Q5TGU0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPO2Q5TGU0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSPO2Q5TGU0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPO2Q5TGU0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPO2Q5TGU0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPO2Q5TGU0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPO2Q5TGU0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPO2Q5TGU0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSPO2Q5TGU0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSPO2Q5TGU0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TSPO2Q5TGU0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TSPO2Q5TGU0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSPO2Q5TGU0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPO2Q5TGU0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPO2Q5TGU0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPO2Q5TGU0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPO2Q5TGU0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPO2Q5TGU0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPO2Q5TGU0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPO2Q5TGU0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPO2Q5TGU0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPO2Q5TGU0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPO2Q5TGU0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPO2Q5TGU0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPO2Q5TGU0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPO2Q5TGU0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPO2Q5TGU0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPO2Q5TGU0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPO2Q5TGU0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPO2Q5TGU0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPO2Q5TGU0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPO2Q5TGU0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPO2Q5TGU0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPO2Q5TGU0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSPO2Q5TGU0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSPO2Q5TGU0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms