Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
PIP4K2BP78356 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
PIP4K2BP78356 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
PIP4K2BP78356 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
PIP4K2BP78356 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
PIP4K2BP78356 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
PIP4K2BP78356 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PIP4K2BP78356 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PIP4K2BP78356 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PIP4K2BP78356 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PIP4K2BP78356 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PIP4K2BP78356 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
PIP4K2BP78356 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PIP4K2BP78356 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
PIP4K2BP78356 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PIP4K2BP78356 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PIP4K2BP78356 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
PIP4K2BP78356 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
PIP4K2BP78356 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
PIP4K2BP78356 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PIP4K2BP78356 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PIP4K2BP78356 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PIP4K2BP78356 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
PIP4K2BP78356 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
PIP4K2BP78356 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
PIP4K2BP78356 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PIP4K2BP78356 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
PIP4K2BP78356 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
PIP4K2BP78356 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
PIP4K2BP78356 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
PIP4K2BP78356 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
PIP4K2BP78356 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
PIP4K2BP78356 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
PIP4K2BP78356 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
PIP4K2BP78356 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
PIP4K2BP78356 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PIP4K2BP78356 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
PIP4K2BP78356 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
PIP4K2BP78356 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
PIP4K2BP78356 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
PIP4K2BP78356 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PIP4K2BP78356 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
PIP4K2BP78356 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
PIP4K2BP78356 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
PIP4K2BP78356 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
PIP4K2BP78356 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
PIP4K2BP78356 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PIP4K2BP78356 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
PIP4K2BP78356 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
PIP4K2BP78356 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
PIP4K2BP78356 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
PIP4K2BP78356 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
PIP4K2BP78356 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
PIP4K2BP78356 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
PIP4K2BP78356 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
PIP4K2BP78356 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
PIP4K2BP78356 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
PIP4K2BP78356 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
PIP4K2BP78356 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
PIP4K2BP78356 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC38.65■■■■□ 3.78
PIP4K2BP78356 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
PIP4K2BP78356 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
PIP4K2BP78356 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
PIP4K2BP78356 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
PIP4K2BP78356 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
PIP4K2BP78356 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
PIP4K2BP78356 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
PIP4K2BP78356 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
PIP4K2BP78356 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
PIP4K2BP78356 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
PIP4K2BP78356 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PIP4K2BP78356 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
PIP4K2BP78356 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
PIP4K2BP78356 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
PIP4K2BP78356 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
PIP4K2BP78356 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
PIP4K2BP78356 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
PIP4K2BP78356 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PIP4K2BP78356 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PIP4K2BP78356 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
PIP4K2BP78356 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PIP4K2BP78356 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
PIP4K2BP78356 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
PIP4K2BP78356 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
PIP4K2BP78356 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
PIP4K2BP78356 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
PIP4K2BP78356 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PIP4K2BP78356 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
PIP4K2BP78356 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PIP4K2BP78356 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
PIP4K2BP78356 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
PIP4K2BP78356 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.72
PIP4K2BP78356 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
PIP4K2BP78356 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.72
PIP4K2BP78356 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PIP4K2BP78356 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
PIP4K2BP78356 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PIP4K2BP78356 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PIP4K2BP78356 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PIP4K2BP78356 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.2 ms