Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM258P61165 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM258P61165 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM258P61165 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM258P61165 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM258P61165 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM258P61165 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM258P61165 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM258P61165 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM258P61165 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM258P61165 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM258P61165 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM258P61165 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM258P61165 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM258P61165 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TMEM258P61165 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM258P61165 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM258P61165 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM258P61165 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM258P61165 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM258P61165 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM258P61165 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM258P61165 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM258P61165 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM258P61165 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM258P61165 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM258P61165 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM258P61165 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM258P61165 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM258P61165 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM258P61165 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM258P61165 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM258P61165 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM258P61165 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM258P61165 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM258P61165 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM258P61165 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM258P61165 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM258P61165 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM258P61165 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM258P61165 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM258P61165 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM258P61165 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM258P61165 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM258P61165 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM258P61165 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM258P61165 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM258P61165 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM258P61165 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM258P61165 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM258P61165 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM258P61165 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM258P61165 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM258P61165 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM258P61165 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM258P61165 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM258P61165 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM258P61165 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM258P61165 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM258P61165 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM258P61165 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM258P61165 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM258P61165 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM258P61165 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM258P61165 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM258P61165 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM258P61165 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM258P61165 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM258P61165 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM258P61165 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM258P61165 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM258P61165 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM258P61165 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM258P61165 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM258P61165 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM258P61165 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM258P61165 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM258P61165 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM258P61165 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM258P61165 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM258P61165 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM258P61165 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM258P61165 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM258P61165 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM258P61165 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM258P61165 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM258P61165 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM258P61165 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM258P61165 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM258P61165 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM258P61165 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM258P61165 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM258P61165 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM258P61165 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM258P61165 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM258P61165 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM258P61165 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM258P61165 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM258P61165 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM258P61165 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms