Protein–RNA interactions for Protein: P52849

NDST2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST2P52849 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NDST2P52849 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NDST2P52849 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NDST2P52849 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NDST2P52849 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NDST2P52849 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NDST2P52849 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NDST2P52849 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NDST2P52849 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NDST2P52849 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NDST2P52849 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NDST2P52849 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NDST2P52849 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NDST2P52849 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NDST2P52849 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NDST2P52849 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NDST2P52849 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NDST2P52849 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NDST2P52849 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NDST2P52849 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NDST2P52849 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NDST2P52849 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NDST2P52849 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NDST2P52849 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NDST2P52849 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NDST2P52849 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NDST2P52849 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NDST2P52849 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NDST2P52849 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NDST2P52849 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NDST2P52849 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NDST2P52849 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NDST2P52849 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NDST2P52849 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NDST2P52849 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NDST2P52849 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NDST2P52849 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NDST2P52849 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NDST2P52849 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NDST2P52849 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NDST2P52849 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NDST2P52849 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NDST2P52849 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NDST2P52849 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NDST2P52849 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NDST2P52849 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NDST2P52849 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NDST2P52849 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NDST2P52849 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NDST2P52849 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NDST2P52849 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NDST2P52849 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NDST2P52849 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NDST2P52849 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NDST2P52849 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NDST2P52849 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NDST2P52849 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NDST2P52849 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NDST2P52849 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NDST2P52849 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NDST2P52849 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NDST2P52849 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NDST2P52849 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NDST2P52849 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NDST2P52849 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NDST2P52849 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NDST2P52849 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NDST2P52849 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NDST2P52849 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NDST2P52849 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NDST2P52849 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NDST2P52849 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NDST2P52849 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NDST2P52849 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDST2P52849 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDST2P52849 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDST2P52849 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDST2P52849 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDST2P52849 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NDST2P52849 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NDST2P52849 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NDST2P52849 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NDST2P52849 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NDST2P52849 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDST2P52849 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDST2P52849 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDST2P52849 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NDST2P52849 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NDST2P52849 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NDST2P52849 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NDST2P52849 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDST2P52849 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDST2P52849 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDST2P52849 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDST2P52849 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDST2P52849 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDST2P52849 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NDST2P52849 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NDST2P52849 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NDST2P52849 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms