Protein–RNA interactions for Protein: P21741

MDK, Midkine, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDKP21741 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MDKP21741 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDKP21741 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDKP21741 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDKP21741 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDKP21741 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDKP21741 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDKP21741 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDKP21741 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDKP21741 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDKP21741 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDKP21741 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDKP21741 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MDKP21741 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDKP21741 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDKP21741 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDKP21741 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDKP21741 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDKP21741 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDKP21741 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDKP21741 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDKP21741 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MDKP21741 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDKP21741 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDKP21741 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDKP21741 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDKP21741 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDKP21741 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDKP21741 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDKP21741 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDKP21741 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDKP21741 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MDKP21741 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDKP21741 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDKP21741 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDKP21741 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDKP21741 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MDKP21741 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDKP21741 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDKP21741 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDKP21741 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDKP21741 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDKP21741 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDKP21741 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDKP21741 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDKP21741 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDKP21741 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDKP21741 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDKP21741 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDKP21741 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDKP21741 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDKP21741 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDKP21741 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDKP21741 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MDKP21741 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDKP21741 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDKP21741 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDKP21741 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDKP21741 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDKP21741 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDKP21741 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDKP21741 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDKP21741 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDKP21741 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDKP21741 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDKP21741 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDKP21741 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDKP21741 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDKP21741 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDKP21741 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDKP21741 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDKP21741 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDKP21741 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDKP21741 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDKP21741 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDKP21741 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDKP21741 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MDKP21741 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDKP21741 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDKP21741 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDKP21741 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDKP21741 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MDKP21741 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDKP21741 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDKP21741 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDKP21741 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDKP21741 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDKP21741 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDKP21741 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDKP21741 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDKP21741 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDKP21741 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDKP21741 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDKP21741 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDKP21741 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDKP21741 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MDKP21741 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDKP21741 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDKP21741 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDKP21741 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms