Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
TRHP20396 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC44.45■■■■■ 4.71
TRHP20396 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.44■■■■■ 4.7
TRHP20396 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
TRHP20396 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
TRHP20396 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
TRHP20396 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.43■■■■■ 4.7
TRHP20396 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC44.39■■■■■ 4.7
TRHP20396 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.7
TRHP20396 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC44.37■■■■■ 4.69
TRHP20396 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC44.36■■■■■ 4.69
TRHP20396 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC44.36■■■■■ 4.69
TRHP20396 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
TRHP20396 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC44.35■■■■■ 4.69
TRHP20396 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.35■■■■■ 4.69
TRHP20396 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC44.35■■■■■ 4.69
TRHP20396 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
TRHP20396 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
TRHP20396 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
TRHP20396 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC44.32■■■■■ 4.69
TRHP20396 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC44.32■■■■■ 4.69
TRHP20396 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
TRHP20396 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
TRHP20396 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
TRHP20396 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC44.26■■■■■ 4.68
TRHP20396 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
TRHP20396 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.25■■■■■ 4.67
TRHP20396 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
TRHP20396 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC44.23■■■■■ 4.67
TRHP20396 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
TRHP20396 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
TRHP20396 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC44.21■■■■■ 4.67
TRHP20396 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC44.2■■■■■ 4.67
TRHP20396 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
TRHP20396 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
TRHP20396 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
TRHP20396 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
TRHP20396 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
TRHP20396 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
TRHP20396 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC44.12■■■■■ 4.65
TRHP20396 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
TRHP20396 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC44.11■■■■■ 4.65
TRHP20396 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC44.1■■■■■ 4.65
TRHP20396 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
TRHP20396 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
TRHP20396 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
TRHP20396 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC44.06■■■■■ 4.64
TRHP20396 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
TRHP20396 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC44.04■■■■■ 4.64
TRHP20396 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC44.04■■■■■ 4.64
TRHP20396 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC44.04■■■■■ 4.64
TRHP20396 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC44.01■■■■■ 4.64
TRHP20396 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
TRHP20396 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
TRHP20396 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
TRHP20396 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
TRHP20396 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
TRHP20396 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
TRHP20396 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
TRHP20396 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC43.91■■■■■ 4.62
TRHP20396 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
TRHP20396 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.62
TRHP20396 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
TRHP20396 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC43.86■■■■■ 4.61
TRHP20396 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC43.86■■■■■ 4.61
TRHP20396 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC43.84■■■■■ 4.61
TRHP20396 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
TRHP20396 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
TRHP20396 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC43.82■■■■■ 4.61
TRHP20396 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.61
TRHP20396 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
TRHP20396 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC43.79■■■■■ 4.6
TRHP20396 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
TRHP20396 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
TRHP20396 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC43.78■■■■■ 4.6
TRHP20396 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC43.77■■■■■ 4.6
TRHP20396 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
TRHP20396 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC43.72■■■■■ 4.59
TRHP20396 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC43.72■■■■■ 4.59
TRHP20396 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
TRHP20396 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC43.68■■■■■ 4.58
TRHP20396 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
TRHP20396 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
TRHP20396 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.67■■■■■ 4.58
TRHP20396 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC43.67■■■■■ 4.58
TRHP20396 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC43.65■■■■■ 4.58
TRHP20396 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
TRHP20396 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
TRHP20396 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
TRHP20396 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
TRHP20396 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC43.56■■■■■ 4.56
TRHP20396 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC43.55■■■■■ 4.56
TRHP20396 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
TRHP20396 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
TRHP20396 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
TRHP20396 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC43.53■■■■■ 4.56
TRHP20396 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC43.52■■■■■ 4.56
TRHP20396 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.52■■■■■ 4.56
TRHP20396 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.5■■■■■ 4.55
TRHP20396 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.5■■■■■ 4.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.7 ms