Protein–RNA interactions for Protein: P04049

RAF1, RAF proto-oncogene serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAF1P04049 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAF1P04049 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAF1P04049 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAF1P04049 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAF1P04049 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAF1P04049 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAF1P04049 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAF1P04049 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAF1P04049 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAF1P04049 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAF1P04049 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAF1P04049 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAF1P04049 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAF1P04049 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAF1P04049 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAF1P04049 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAF1P04049 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAF1P04049 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAF1P04049 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAF1P04049 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAF1P04049 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAF1P04049 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAF1P04049 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAF1P04049 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAF1P04049 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAF1P04049 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RAF1P04049 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAF1P04049 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAF1P04049 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAF1P04049 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAF1P04049 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAF1P04049 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAF1P04049 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAF1P04049 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAF1P04049 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAF1P04049 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAF1P04049 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAF1P04049 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAF1P04049 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAF1P04049 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAF1P04049 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAF1P04049 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAF1P04049 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RAF1P04049 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAF1P04049 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAF1P04049 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAF1P04049 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAF1P04049 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAF1P04049 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAF1P04049 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAF1P04049 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAF1P04049 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAF1P04049 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAF1P04049 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAF1P04049 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAF1P04049 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAF1P04049 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAF1P04049 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAF1P04049 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAF1P04049 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAF1P04049 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAF1P04049 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAF1P04049 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAF1P04049 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAF1P04049 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RAF1P04049 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAF1P04049 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RAF1P04049 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAF1P04049 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAF1P04049 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAF1P04049 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAF1P04049 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAF1P04049 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAF1P04049 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAF1P04049 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAF1P04049 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAF1P04049 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAF1P04049 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAF1P04049 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAF1P04049 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAF1P04049 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAF1P04049 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAF1P04049 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAF1P04049 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAF1P04049 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAF1P04049 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAF1P04049 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAF1P04049 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAF1P04049 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAF1P04049 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAF1P04049 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAF1P04049 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAF1P04049 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAF1P04049 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAF1P04049 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAF1P04049 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAF1P04049 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAF1P04049 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAF1P04049 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAF1P04049 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms