Protein–RNA interactions for Protein: O95379

TNFAIP8, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8O95379 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP8O95379 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP8O95379 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP8O95379 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP8O95379 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP8O95379 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP8O95379 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP8O95379 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP8O95379 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP8O95379 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP8O95379 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP8O95379 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP8O95379 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP8O95379 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP8O95379 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFAIP8O95379 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP8O95379 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP8O95379 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP8O95379 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP8O95379 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP8O95379 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP8O95379 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP8O95379 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP8O95379 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP8O95379 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP8O95379 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP8O95379 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP8O95379 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP8O95379 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP8O95379 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP8O95379 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP8O95379 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP8O95379 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP8O95379 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP8O95379 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP8O95379 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP8O95379 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP8O95379 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP8O95379 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP8O95379 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP8O95379 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP8O95379 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP8O95379 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP8O95379 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP8O95379 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP8O95379 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP8O95379 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP8O95379 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP8O95379 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP8O95379 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP8O95379 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP8O95379 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP8O95379 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP8O95379 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP8O95379 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP8O95379 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP8O95379 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP8O95379 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP8O95379 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP8O95379 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP8O95379 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP8O95379 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP8O95379 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP8O95379 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP8O95379 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFAIP8O95379 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFAIP8O95379 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFAIP8O95379 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFAIP8O95379 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
TNFAIP8O95379 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP8O95379 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP8O95379 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP8O95379 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP8O95379 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP8O95379 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP8O95379 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP8O95379 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP8O95379 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP8O95379 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFAIP8O95379 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFAIP8O95379 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms