Protein–RNA interactions for Protein: O60229

KALRN, Kalirin, humanhuman

Predictions only

Length 2,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KALRNO60229 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KALRNO60229 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KALRNO60229 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KALRNO60229 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KALRNO60229 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KALRNO60229 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KALRNO60229 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KALRNO60229 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KALRNO60229 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KALRNO60229 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KALRNO60229 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KALRNO60229 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KALRNO60229 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KALRNO60229 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KALRNO60229 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KALRNO60229 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KALRNO60229 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KALRNO60229 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KALRNO60229 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KALRNO60229 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KALRNO60229 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KALRNO60229 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KALRNO60229 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KALRNO60229 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KALRNO60229 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KALRNO60229 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KALRNO60229 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KALRNO60229 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KALRNO60229 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KALRNO60229 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KALRNO60229 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KALRNO60229 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KALRNO60229 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KALRNO60229 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KALRNO60229 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KALRNO60229 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KALRNO60229 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KALRNO60229 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KALRNO60229 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KALRNO60229 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KALRNO60229 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KALRNO60229 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KALRNO60229 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KALRNO60229 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KALRNO60229 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KALRNO60229 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KALRNO60229 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KALRNO60229 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KALRNO60229 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KALRNO60229 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KALRNO60229 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KALRNO60229 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KALRNO60229 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KALRNO60229 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KALRNO60229 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KALRNO60229 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KALRNO60229 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KALRNO60229 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KALRNO60229 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KALRNO60229 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KALRNO60229 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KALRNO60229 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KALRNO60229 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KALRNO60229 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KALRNO60229 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KALRNO60229 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KALRNO60229 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KALRNO60229 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KALRNO60229 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KALRNO60229 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KALRNO60229 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KALRNO60229 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KALRNO60229 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KALRNO60229 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KALRNO60229 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KALRNO60229 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KALRNO60229 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KALRNO60229 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KALRNO60229 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KALRNO60229 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KALRNO60229 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KALRNO60229 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KALRNO60229 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KALRNO60229 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KALRNO60229 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KALRNO60229 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KALRNO60229 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KALRNO60229 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KALRNO60229 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KALRNO60229 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KALRNO60229 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KALRNO60229 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KALRNO60229 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KALRNO60229 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KALRNO60229 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KALRNO60229 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KALRNO60229 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KALRNO60229 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KALRNO60229 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KALRNO60229 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms