Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATCO43716 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GATCO43716 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GATCO43716 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GATCO43716 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GATCO43716 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GATCO43716 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GATCO43716 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GATCO43716 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GATCO43716 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GATCO43716 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GATCO43716 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GATCO43716 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GATCO43716 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GATCO43716 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GATCO43716 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GATCO43716 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GATCO43716 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GATCO43716 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GATCO43716 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GATCO43716 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GATCO43716 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GATCO43716 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GATCO43716 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GATCO43716 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GATCO43716 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GATCO43716 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GATCO43716 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATCO43716 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATCO43716 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATCO43716 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATCO43716 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GATCO43716 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GATCO43716 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GATCO43716 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GATCO43716 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GATCO43716 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GATCO43716 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GATCO43716 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GATCO43716 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GATCO43716 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GATCO43716 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GATCO43716 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GATCO43716 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GATCO43716 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATCO43716 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATCO43716 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATCO43716 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GATCO43716 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GATCO43716 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GATCO43716 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GATCO43716 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GATCO43716 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GATCO43716 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GATCO43716 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GATCO43716 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GATCO43716 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GATCO43716 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GATCO43716 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GATCO43716 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GATCO43716 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GATCO43716 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GATCO43716 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GATCO43716 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GATCO43716 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GATCO43716 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GATCO43716 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GATCO43716 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GATCO43716 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GATCO43716 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GATCO43716 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GATCO43716 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GATCO43716 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GATCO43716 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GATCO43716 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GATCO43716 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GATCO43716 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GATCO43716 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GATCO43716 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GATCO43716 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GATCO43716 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GATCO43716 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATCO43716 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATCO43716 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATCO43716 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATCO43716 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATCO43716 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GATCO43716 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GATCO43716 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GATCO43716 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GATCO43716 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GATCO43716 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GATCO43716 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GATCO43716 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATCO43716 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATCO43716 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATCO43716 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATCO43716 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATCO43716 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATCO43716 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms