Protein–RNA interactions for Protein: H3BSA7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BSA7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H3BSA7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
H3BSA7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H3BSA7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H3BSA7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H3BSA7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BSA7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BSA7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
H3BSA7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
H3BSA7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
H3BSA7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
H3BSA7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BSA7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BSA7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BSA7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BSA7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BSA7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BSA7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BSA7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BSA7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BSA7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BSA7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BSA7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
H3BSA7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BSA7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BSA7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BSA7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BSA7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BSA7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BSA7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BSA7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BSA7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BSA7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BSA7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BSA7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BSA7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H3BSA7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H3BSA7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BSA7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BSA7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BSA7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BSA7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BSA7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BSA7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BSA7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BSA7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BSA7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BSA7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BSA7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BSA7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BSA7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BSA7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BSA7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H3BSA7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H3BSA7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H3BSA7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BSA7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BSA7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BSA7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BSA7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H3BSA7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BSA7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BSA7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BSA7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BSA7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BSA7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BSA7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BSA7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BSA7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BSA7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BSA7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BSA7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BSA7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BSA7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BSA7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BSA7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BSA7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BSA7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BSA7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BSA7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BSA7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BSA7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BSA7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BSA7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BSA7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BSA7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BSA7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BSA7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BSA7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BSA7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BSA7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BSA7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BSA7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BSA7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BSA7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BSA7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BSA7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BSA7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BSA7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BSA7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms