Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BATF3Q9NR55 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms