Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS2Q9BXC9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms