Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D1

PDCD7, Programmed cell death protein 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD7Q8N8D1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.4 ms