Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPARCL1Q14515 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPARCL1Q14515 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPARCL1Q14515 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPARCL1Q14515 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPARCL1Q14515 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPARCL1Q14515 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPARCL1Q14515 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPARCL1Q14515 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPARCL1Q14515 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPARCL1Q14515 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPARCL1Q14515 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPARCL1Q14515 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPARCL1Q14515 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPARCL1Q14515 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPARCL1Q14515 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPARCL1Q14515 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPARCL1Q14515 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPARCL1Q14515 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPARCL1Q14515 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPARCL1Q14515 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPARCL1Q14515 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms