Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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