Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIGQ13278 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIGQ13278 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIGQ13278 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIGQ13278 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RIGQ13278 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIGQ13278 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIGQ13278 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIGQ13278 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIGQ13278 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIGQ13278 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIGQ13278 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIGQ13278 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIGQ13278 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIGQ13278 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIGQ13278 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RIGQ13278 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RIGQ13278 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIGQ13278 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RIGQ13278 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIGQ13278 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIGQ13278 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIGQ13278 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIGQ13278 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIGQ13278 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RIGQ13278 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIGQ13278 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIGQ13278 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIGQ13278 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIGQ13278 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIGQ13278 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIGQ13278 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIGQ13278 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIGQ13278 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIGQ13278 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIGQ13278 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIGQ13278 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIGQ13278 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIGQ13278 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIGQ13278 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIGQ13278 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIGQ13278 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIGQ13278 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIGQ13278 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIGQ13278 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIGQ13278 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIGQ13278 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIGQ13278 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIGQ13278 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIGQ13278 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RIGQ13278 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIGQ13278 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIGQ13278 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIGQ13278 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIGQ13278 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIGQ13278 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIGQ13278 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIGQ13278 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIGQ13278 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIGQ13278 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIGQ13278 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIGQ13278 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIGQ13278 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIGQ13278 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIGQ13278 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIGQ13278 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIGQ13278 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIGQ13278 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIGQ13278 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIGQ13278 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIGQ13278 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIGQ13278 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIGQ13278 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIGQ13278 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIGQ13278 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RIGQ13278 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIGQ13278 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIGQ13278 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIGQ13278 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIGQ13278 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIGQ13278 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIGQ13278 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIGQ13278 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIGQ13278 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIGQ13278 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIGQ13278 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIGQ13278 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIGQ13278 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIGQ13278 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIGQ13278 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIGQ13278 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIGQ13278 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIGQ13278 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIGQ13278 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIGQ13278 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIGQ13278 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIGQ13278 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIGQ13278 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIGQ13278 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIGQ13278 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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