Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPA3P35244 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPA3P35244 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPA3P35244 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPA3P35244 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPA3P35244 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPA3P35244 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPA3P35244 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPA3P35244 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPA3P35244 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPA3P35244 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA3P35244 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA3P35244 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA3P35244 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA3P35244 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA3P35244 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA3P35244 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA3P35244 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA3P35244 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA3P35244 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA3P35244 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA3P35244 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA3P35244 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA3P35244 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA3P35244 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA3P35244 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA3P35244 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA3P35244 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA3P35244 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA3P35244 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA3P35244 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA3P35244 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA3P35244 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPA3P35244 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPA3P35244 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPA3P35244 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPA3P35244 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPA3P35244 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPA3P35244 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPA3P35244 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPA3P35244 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPA3P35244 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPA3P35244 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA3P35244 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA3P35244 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA3P35244 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA3P35244 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA3P35244 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA3P35244 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA3P35244 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA3P35244 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA3P35244 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA3P35244 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA3P35244 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA3P35244 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA3P35244 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA3P35244 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA3P35244 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA3P35244 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA3P35244 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA3P35244 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA3P35244 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPA3P35244 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RPA3P35244 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPA3P35244 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPA3P35244 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPA3P35244 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPA3P35244 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPA3P35244 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPA3P35244 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPA3P35244 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPA3P35244 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPA3P35244 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA3P35244 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA3P35244 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA3P35244 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA3P35244 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA3P35244 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA3P35244 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA3P35244 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA3P35244 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA3P35244 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA3P35244 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA3P35244 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA3P35244 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA3P35244 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA3P35244 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA3P35244 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA3P35244 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA3P35244 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA3P35244 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA3P35244 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA3P35244 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA3P35244 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA3P35244 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA3P35244 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA3P35244 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA3P35244 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA3P35244 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA3P35244 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms