Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP6P35125 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP6P35125 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
USP6P35125 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP6P35125 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP6P35125 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP6P35125 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP6P35125 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP6P35125 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP6P35125 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP6P35125 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
USP6P35125 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
USP6P35125 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP6P35125 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP6P35125 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP6P35125 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP6P35125 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP6P35125 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
USP6P35125 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP6P35125 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP6P35125 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP6P35125 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP6P35125 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP6P35125 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP6P35125 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP6P35125 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP6P35125 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP6P35125 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP6P35125 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP6P35125 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP6P35125 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
USP6P35125 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP6P35125 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP6P35125 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
USP6P35125 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP6P35125 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP6P35125 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
USP6P35125 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP6P35125 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
USP6P35125 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP6P35125 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP6P35125 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP6P35125 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP6P35125 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP6P35125 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP6P35125 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP6P35125 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP6P35125 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP6P35125 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP6P35125 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP6P35125 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP6P35125 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP6P35125 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP6P35125 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP6P35125 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
USP6P35125 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP6P35125 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP6P35125 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP6P35125 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP6P35125 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP6P35125 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP6P35125 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP6P35125 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP6P35125 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP6P35125 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP6P35125 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP6P35125 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP6P35125 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP6P35125 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
USP6P35125 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP6P35125 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP6P35125 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP6P35125 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP6P35125 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP6P35125 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP6P35125 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP6P35125 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP6P35125 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP6P35125 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP6P35125 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP6P35125 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP6P35125 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
USP6P35125 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP6P35125 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP6P35125 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
USP6P35125 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP6P35125 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP6P35125 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP6P35125 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP6P35125 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP6P35125 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP6P35125 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP6P35125 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP6P35125 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP6P35125 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP6P35125 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP6P35125 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP6P35125 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP6P35125 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP6P35125 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms