Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO2P25791 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO2P25791 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO2P25791 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO2P25791 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO2P25791 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO2P25791 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO2P25791 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO2P25791 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMO2P25791 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMO2P25791 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMO2P25791 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMO2P25791 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMO2P25791 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMO2P25791 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMO2P25791 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMO2P25791 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO2P25791 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO2P25791 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO2P25791 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO2P25791 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO2P25791 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO2P25791 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO2P25791 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO2P25791 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO2P25791 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO2P25791 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO2P25791 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO2P25791 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO2P25791 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO2P25791 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO2P25791 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO2P25791 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO2P25791 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO2P25791 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO2P25791 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO2P25791 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO2P25791 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO2P25791 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO2P25791 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO2P25791 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO2P25791 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO2P25791 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMO2P25791 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMO2P25791 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMO2P25791 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMO2P25791 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMO2P25791 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMO2P25791 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LMO2P25791 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMO2P25791 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMO2P25791 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMO2P25791 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LMO2P25791 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMO2P25791 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO2P25791 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO2P25791 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO2P25791 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO2P25791 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO2P25791 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO2P25791 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO2P25791 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO2P25791 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO2P25791 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO2P25791 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO2P25791 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO2P25791 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO2P25791 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO2P25791 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO2P25791 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO2P25791 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO2P25791 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO2P25791 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO2P25791 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO2P25791 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO2P25791 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO2P25791 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO2P25791 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO2P25791 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO2P25791 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO2P25791 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO2P25791 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO2P25791 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO2P25791 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO2P25791 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMO2P25791 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMO2P25791 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LMO2P25791 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMO2P25791 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
LMO2P25791 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
LMO2P25791 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMO2P25791 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMO2P25791 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMO2P25791 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMO2P25791 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMO2P25791 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMO2P25791 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMO2P25791 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMO2P25791 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMO2P25791 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms