Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF2P04141 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF2P04141 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF2P04141 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF2P04141 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF2P04141 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF2P04141 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF2P04141 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF2P04141 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF2P04141 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF2P04141 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF2P04141 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF2P04141 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF2P04141 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF2P04141 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF2P04141 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF2P04141 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF2P04141 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF2P04141 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF2P04141 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF2P04141 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF2P04141 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF2P04141 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF2P04141 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF2P04141 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF2P04141 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF2P04141 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF2P04141 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF2P04141 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF2P04141 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF2P04141 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF2P04141 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF2P04141 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF2P04141 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF2P04141 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF2P04141 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF2P04141 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF2P04141 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF2P04141 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF2P04141 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF2P04141 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSF2P04141 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSF2P04141 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSF2P04141 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSF2P04141 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CSF2P04141 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSF2P04141 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CSF2P04141 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSF2P04141 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSF2P04141 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF2P04141 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF2P04141 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF2P04141 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF2P04141 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF2P04141 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF2P04141 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF2P04141 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF2P04141 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF2P04141 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF2P04141 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF2P04141 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF2P04141 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF2P04141 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF2P04141 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF2P04141 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF2P04141 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF2P04141 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF2P04141 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF2P04141 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF2P04141 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF2P04141 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF2P04141 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF2P04141 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF2P04141 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF2P04141 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF2P04141 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF2P04141 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF2P04141 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF2P04141 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF2P04141 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSF2P04141 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSF2P04141 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSF2P04141 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSF2P04141 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CSF2P04141 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSF2P04141 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CSF2P04141 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSF2P04141 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSF2P04141 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CSF2P04141 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CSF2P04141 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CSF2P04141 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CSF2P04141 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSF2P04141 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSF2P04141 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CSF2P04141 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CSF2P04141 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSF2P04141 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSF2P04141 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSF2P04141 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms