Protein–RNA interactions for Protein: O14829

PPEF1, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPEF1O14829 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPEF1O14829 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPEF1O14829 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPEF1O14829 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPEF1O14829 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPEF1O14829 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPEF1O14829 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPEF1O14829 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPEF1O14829 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPEF1O14829 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPEF1O14829 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPEF1O14829 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPEF1O14829 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPEF1O14829 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPEF1O14829 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPEF1O14829 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPEF1O14829 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PPEF1O14829 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PPEF1O14829 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PPEF1O14829 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PPEF1O14829 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPEF1O14829 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPEF1O14829 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PPEF1O14829 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPEF1O14829 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PPEF1O14829 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPEF1O14829 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPEF1O14829 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPEF1O14829 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPEF1O14829 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPEF1O14829 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms