Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAD1O00515 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAD1O00515 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAD1O00515 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAD1O00515 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAD1O00515 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAD1O00515 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAD1O00515 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAD1O00515 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LAD1O00515 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LAD1O00515 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAD1O00515 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAD1O00515 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAD1O00515 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAD1O00515 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAD1O00515 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAD1O00515 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAD1O00515 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAD1O00515 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAD1O00515 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LAD1O00515 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAD1O00515 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAD1O00515 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAD1O00515 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LAD1O00515 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAD1O00515 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAD1O00515 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAD1O00515 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAD1O00515 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAD1O00515 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAD1O00515 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAD1O00515 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LAD1O00515 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAD1O00515 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAD1O00515 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAD1O00515 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LAD1O00515 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAD1O00515 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAD1O00515 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAD1O00515 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAD1O00515 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAD1O00515 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAD1O00515 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAD1O00515 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LAD1O00515 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAD1O00515 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAD1O00515 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAD1O00515 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAD1O00515 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAD1O00515 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAD1O00515 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAD1O00515 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAD1O00515 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAD1O00515 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAD1O00515 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAD1O00515 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAD1O00515 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAD1O00515 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAD1O00515 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAD1O00515 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAD1O00515 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAD1O00515 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAD1O00515 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAD1O00515 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAD1O00515 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAD1O00515 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAD1O00515 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAD1O00515 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAD1O00515 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAD1O00515 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAD1O00515 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LAD1O00515 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LAD1O00515 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LAD1O00515 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAD1O00515 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAD1O00515 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAD1O00515 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAD1O00515 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAD1O00515 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAD1O00515 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAD1O00515 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAD1O00515 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAD1O00515 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAD1O00515 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAD1O00515 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAD1O00515 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAD1O00515 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAD1O00515 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAD1O00515 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAD1O00515 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAD1O00515 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAD1O00515 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAD1O00515 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAD1O00515 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAD1O00515 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAD1O00515 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAD1O00515 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAD1O00515 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAD1O00515 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAD1O00515 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms