Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHMG1C9JSJ3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms