Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
BSDC1Q9NW68 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BSDC1Q9NW68 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms