Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.373e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.223e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 NPM3-204ENST00000474993 755 ntTSL 221.91■■□□□ 1.13e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 GNAS-238ENST00000480975 1534 ntTSL 521.1■□□□□ 0.973e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.883e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.833e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.233e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.233e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.313e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 GNAS-222ENST00000464624 3764 ntTSL 513.06□□□□□ -0.323e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 GNAS-245ENST00000487862 1782 ntTSL 211.89□□□□□ -0.513e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.573e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 GNAS-232ENST00000476196 1839 ntTSL 211.32□□□□□ -0.63e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 LSM3-201ENST00000306024 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.673e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 GNAS-208ENST00000371075 2551 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.83e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 GNAS-204ENST00000313949 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.853e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 LSM14A-206ENST00000588582 3601 ntTSL 29.06□□□□□ -0.963e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 GNAS-255ENST00000496934 2837 ntTSL 27□□□□□ -1.293e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.523e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.563e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.783e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 SCD-201ENST00000370355 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.974e-7■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 CANX-207ENST00000503303 345 ntTSL 58.79□□□□□ -15e-11■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.084e-7■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.814e-7■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 YWHAZ-215ENST00000518736 883 ntTSL 319.95■□□□□ 0.784e-7■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.574e-7■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.564e-7■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 YWHAZ-214ENST00000517727 876 ntTSL 313.59□□□□□ -0.234e-7■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.374e-7■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 YWHAZ-216ENST00000521309 1399 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.54e-7■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 YWHAZ-207ENST00000395958 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.614e-7■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 YWHAZ-202ENST00000395948 812 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.844e-7■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 YWHAZ-212ENST00000480304 2247 ntTSL 29.45□□□□□ -0.94e-7■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.434e-7■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 YWHAZ-222ENST00000523848 664 ntTSL 55.5□□□□□ -1.534e-7■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.814e-7■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.824e-7■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 YWHAZ-218ENST00000521607 750 ntTSL 33.24□□□□□ -1.894e-7■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.894e-7■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.082e-13■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.672e-13■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.532e-13■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.516e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.452e-13■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.263e-9■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -02e-13■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.013e-9■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.056e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.083e-9■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.373e-9■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 SERPINB6-203ENST00000380524 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.692e-13■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 SERPINB6-205ENST00000380539 1338 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.832e-13■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 SERPINB6-202ENST00000380520 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.062e-13■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.683e-9■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 RPN2-206ENST00000456400 453 ntTSL 34.93□□□□□ -1.622e-8■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.742e-7■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.032e-7■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.122e-7■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.152e-7■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 GDI2-202ENST00000380181 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.462e-7■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 AGRN-203ENST00000461111 3385 ntTSL 1 (best)11.32□□□□□ -0.62e-7■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 GDI2-207ENST00000479928 2499 ntTSL 29.28□□□□□ -0.922e-7■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 GDI2-205ENST00000447751 834 ntTSL 32.9□□□□□ -1.952e-7■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.522e-6■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.192e-6■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.352e-6■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPC-209ENST00000554383 1039 ntTSL 511.13□□□□□ -0.634e-6■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS18-236ENST00000490191 996 ntTSL 217.84■□□□□ 0.456e-18■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS18-235ENST00000479802 413 ntTSL 212.89□□□□□ -0.356e-18■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS18-231ENST00000472218 1109 ntTSL 211.35□□□□□ -0.596e-18■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS18-234ENST00000476222 685 ntTSL 1 (best)12.89□□□□□ -0.355e-18■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS18-232ENST00000474626 639 ntTSL 310.7□□□□□ -0.75e-18■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS18-237ENST00000496813 642 ntTSL 210.7□□□□□ -0.75e-18■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 PSMD4-205ENST00000445776 703 ntTSL 319.05■□□□□ 0.645e-8■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 PSMD4-203ENST00000427779 649 ntTSL 318.89■□□□□ 0.615e-8■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.555e-8■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.15e-8■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.265e-8■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 PSMD4-202ENST00000368884 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.325e-8■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 XRCC6-203ENST00000402580 2006 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.645e-8■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 XRCC6-206ENST00000428575 2148 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.665e-8■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 XRCC6-204ENST00000405506 1958 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.745e-8■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 XRCC6-205ENST00000405878 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.815e-8■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 RHAG-202ENST00000371175 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.881e-8■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 PSMD4-206ENST00000453615 371 ntTSL 39.48□□□□□ -0.895e-8■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 UROD-206ENST00000461035 486 ntTSL 1 (best)9.09□□□□□ -0.955e-8■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 XPO1-203ENST00000406957 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.028e-10■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 XRCC6-207ENST00000464116 359 ntTSL 28.1□□□□□ -1.115e-8■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 XPO1-209ENST00000443240 565 ntTSL 43.41□□□□□ -1.868e-10■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 XPO1-207ENST00000436018 318 ntTSL 43.1□□□□□ -1.918e-10■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 GAS5-222ENST00000451607 1007 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.482e-20■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 GAS5-224ENST00000454068 688 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.712e-20■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.132e-20■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 GAS5-228ENST00000456812 723 ntTSL 37.37□□□□□ -1.232e-20■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 GAS5-206ENST00000422183 745 ntTSL 26.52□□□□□ -1.372e-20■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.372e-20■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 GAS5-205ENST00000422008 497 ntTSL 35.02□□□□□ -1.612e-20■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.632e-20■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 GAS5-215ENST00000442067 1114 ntTSL 24.6□□□□□ -1.672e-20■□□□□ 9.1
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