Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNHG12Q9BXW3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms