Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSEN34Q9BSV6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms