Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3CQ99985 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms