Protein–RNA interactions for Protein: Q99797

MIPEP, Mitochondrial intermediate peptidase, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPEPQ99797 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MIPEPQ99797 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIPEPQ99797 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms