Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLMNQ96JQ2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLMNQ96JQ2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms