Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX2

ATXN7L3B, Ataxin-7-like protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3BQ96GX2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN7L3BQ96GX2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN7L3BQ96GX2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN7L3BQ96GX2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN7L3BQ96GX2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms