Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DTX3LQ8TDB6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DTX3LQ8TDB6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DTX3LQ8TDB6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DTX3LQ8TDB6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DTX3LQ8TDB6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DTX3LQ8TDB6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DTX3LQ8TDB6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DTX3LQ8TDB6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DTX3LQ8TDB6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DTX3LQ8TDB6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DTX3LQ8TDB6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DTX3LQ8TDB6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DTX3LQ8TDB6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DTX3LQ8TDB6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DTX3LQ8TDB6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DTX3LQ8TDB6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DTX3LQ8TDB6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DTX3LQ8TDB6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DTX3LQ8TDB6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DTX3LQ8TDB6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DTX3LQ8TDB6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DTX3LQ8TDB6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DTX3LQ8TDB6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DTX3LQ8TDB6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DTX3LQ8TDB6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DTX3LQ8TDB6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTX3LQ8TDB6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms