Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms